راحله امینی؛ هادی خاطری؛ ناهید معرف زاده
چکیده
اعضای جنس پولروویروس ازجمله ویروس زردی شلغم (Turnip yellows virus, TuYV) از ویروس‌های مهم در گیاهان زراعی هستند. این ویروس‌ها توسط شته‌ها به‌صورت گردشی- غیرتکثیری انتقال پیدا می‌کنند. طی سال‌های ۱۳۹۷ و ۱۳۹۸ تعداد 32 نمونه‌ی برگ کلزا و یک نمونه خردل وحشی از مزارع استان کرمانشاه جمع‌آوری شد. این نمونه‌ها با کیت تاس-الیزا DSMZ که چهار گونۀ پولروویروس ...
بیشتر
اعضای جنس پولروویروس ازجمله ویروس زردی شلغم (Turnip yellows virus, TuYV) از ویروس‌های مهم در گیاهان زراعی هستند. این ویروس‌ها توسط شته‌ها به‌صورت گردشی- غیرتکثیری انتقال پیدا می‌کنند. طی سال‌های ۱۳۹۷ و ۱۳۹۸ تعداد 32 نمونه‌ی برگ کلزا و یک نمونه خردل وحشی از مزارع استان کرمانشاه جمع‌آوری شد. این نمونه‌ها با کیت تاس-الیزا DSMZ که چهار گونۀ پولروویروس شامل TuYV، Beet mild yellowing virus (BMYV)، Beet western yellows virus (BWYV) و Beet chlorosis virus (BChV) را شناسایی می‌کند، آزمایش شدند. در آزمون تاس-الیزا، هفت نمونه کلزا و نمونه خردل وحشی پاسخ مثبت نشان دادند. برای آزمون انتقال ویروس از Myzus persicae و Brevicoryne brassicae استفاده شد که در گیاهان کلزا و تربچه موفقیت‌آمیز بود ولی آلودگی به چغندرقند منتقل نگردید. در IC-RT-PCR با آغازگرهای اختصاصی، یک قطعه با اندازه ۷۸۰ جفت‌باز از ژن کد کننده P0 از نمونه خردل وحشی و دو نمونه کلزا تکثیر گردید. توالی‌های نوکلئوتیدی جدایه‌های کلزا و خردل وحشی بسیار مشابه بودند (۹۹٫۴ درصد همسانی) و در جستجوی BLAST با توالی‌های نوکلئوتیدی جدایه‌های TuYV، که بسیاری از آن‌ها از استرالیا و از گیاهان مختلف مانند شنبلیله، کلزا، نخودفرنگی و نخود بودند، تا ۹۷٫۲ درصد شباهت داشتند. در تحلیل فیلوژنتیک توالی‌های نوکلئوتیدی ناحیه کدکننده P0، این دو جدایه به همراه سایر جدایه‌های TuYV در یک گروه قرار گرفته و از سایر پولروویروس‌ها مانند BMYV، BWYV و BChV متمایز بودند. در این پژوهش، شناسایی ویروس زردی شلغم در مزارع کلزای ایران بر اساس تعیین توالی نوکلئوتیدی ناحیه کدکننده P0 برای اولین بار در شهرستان کرمانشاه انجام گرفت.
ناهید معرف زاده؛ مجتبی محمدی؛ عباس شریفی تهرانی؛ زهرا ذاکری
دوره 40، شماره 1 ، شهریور 1388
چکیده
بیماری آتشک با عامل باکتریایی Erwinia amylovora از بیماری‌های مهم میوه‌های دانه‌دار محسوب می‌شود. این بیماری طی سال‌های گذشته خسارت‌های هنگفتی به باغ‌های میوه دانه‌دار ایران تحمیل نموده است. استفاده از روش‌های دقیق و قابل اطمینان جهت شناسایی و ردیابی به موقع بیمارگر، به کنترل زود هنگام و جلوگیری از گسترش بیماری و حذف درختان آلوده کمک ...
بیشتر
بیماری آتشک با عامل باکتریایی Erwinia amylovora از بیماری‌های مهم میوه‌های دانه‌دار محسوب می‌شود. این بیماری طی سال‌های گذشته خسارت‌های هنگفتی به باغ‌های میوه دانه‌دار ایران تحمیل نموده است. استفاده از روش‌های دقیق و قابل اطمینان جهت شناسایی و ردیابی به موقع بیمارگر، به کنترل زود هنگام و جلوگیری از گسترش بیماری و حذف درختان آلوده کمک می‌نماید. در این تحقیق دو آنتی‌سرم پلی‌کلونال اختصاصی تهیه شده و برای ردیابی سلول‌های باکتری E. amylovora (Ea) در آزمون‌های نشت در آگار و DIBA مورد استفاده قرار گرفتند. آزمون دیبا قادر به ردیابی710×1 سلول باکتری در هر میلی‌لیتر کشت خالص و نیز عصاره آلوده بود. با غنی‌سازی در محیط مایع کینگ بی، سطح حساسیت دیبا به10 سلول افزایش یافت. در این بررسی کارایی روش‌های سرولوژیکی با برخی از روش‌های مبتنی بر PCRکه جهت شناسایی این باکتری منتشر شده‌اند نیز مقایسه گردید. به این منظور قطعه‌ای یک کیلو بازی از پلازمید pEA29 بنامpstI با استفاده از آغازگرهای A وB در روش PCR تکثیر گردید. سطوح حساسیت این روش در آب و عصاره گیاهی به ترتیب 104×2 و 106×2 سلول در مخلوط واکنش بود. سه روش ذکر شده قادر به شناسایی استرین‌های متعلق به میزبان‌ها و مناطق مختلف کشور بوده و جهت شناسایی Ea در مقایسه با سایر جنس‌های باکتریایی اختصاصی عمل نمودند. در Nested-PCR با استفاده از آغازگرهای AJ75 و AJ76 یک قطعه 800 جفت بازی تکثیر گردید. این روش بسیار حساس توانست در مخلوط واکنش تا یک سلول باکتریایی را در آب و تا 100 سلول را در عصاره گیاهی ردیابی نماید.
