@article { author = {Rahimi, Mansoureh and Sabbagh, Seyed Kazem and Javan Nikkhah, Mohammad and Soltanloo, Hasan and Salari, Mohammad and Panjehkeh, Naser}, title = {Study on the Genetic Diversity of Ascochyta rabiei Isolates, Cause of Chikpea Blight Disease in Lorestan Province Using SSR Marker}, journal = {Iranian Journal of Plant Protection Science}, volume = {44}, number = {2}, pages = {273-282}, year = {2014}, publisher = {University of Tehran}, issn = {2008-4781}, eissn = {2423-7868}, doi = {10.22059/ijpps.2014.36673}, abstract = {Ascochyta blight caused by Ascochyta rabiei is one of the most destructive diseasesaffecting chickpea (Cicer arietinum). To study the genetic diversity of the fungus, fifty threeisolates were rendomly collected from chikpea fields in eight different regions of LorestanProvince namely Azna, Aleshtar, Broujerd, Poldokhtar, Chegeni, Khoorramabad, Koohdasht,Noorabad.The isolates were cultured and purified on specific chickpea seed meal dextrose agarmedium. Genetic diversity among the population was assayed, employing SSR marker andusing five specific primer pairs. Similarity of the isolates was determined using Dice'scoefficient and UPGMA clustering method. Cluster analysis of data revealed that isolates withgenetic similarity distance equal to 3% were placed in 9 distinct genetic groups. PCoA analysisof data was done employing Jaccard similarity matrix in NTSYS software. According to theacquired data, from among 53 components, 15 components stood within an Eigenvalue greaterthan 1 with 90.49 % of variation being justified. Analysis of molecular variance (AMOVA)revealed the highest genetic variation (96%) within populations while distributed amongpopulations by 4%.The results finally indicated that there is considerable genetic diversityamong and between the isolates collected from different regions of the province.}, keywords = {Ascochyta blight,Dice's coeffecient SSR marker,Genetic diversity}, title_fa = {بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌های Ascochyta rabiei، عامل برق‌زدگی نخود در استان لرستان با استفاده از نشانگر SSR}, abstract_fa = {بیماری برق‌زدگی با عامل Ascochyta rabiei یکی از مخرب‌ترین بیماری‌های نخود است. در این تحقیق، با هدف مطالعۀ ساختار ژنتیکی قارچ عامل بیماری، نمونه‌برداری به‌صورت تصادفی از مزارع هشت منطقۀ مختلف استان لرستان (ازنا، الشتر، بروجرد، پلدختر، چگنی، خرم‌آباد، کوهدشت و نورآباد) صورت گرفت. پس از کشت نمونه‌ها روی محیط کشت اختصاصی آرد نخود، دکستروز و آگار، جدایه‌های قارچی با روش نوک هیف خالص‌سازی شد و تعداد 53 جدایۀ خالص به‌دست آمد. تنوع ژنتیکی جمعیت قارچ با نشانگر توالی تکراری ساده و با استفاده از پنج جفت آغازگر اختصاصی ارزیابی شد. تعیین تشابه جدایه با استفاده از ضریب شباهت دایس و روش الگوریتم UPGMA انجام گرفت. تجزیۀ خوشه‌ای داده‌ها نشان داد که جدایه‌ها در فاصلۀ ژنتیکی برابر با سطح تشابه 3/0 درصد در 9 گروه ژنوتیپی مشخص قرار می‌گیرند. آنالیز PCOA داده‌ها با استفاده از ماتریس تشابه جاکارد در نرم‌افزار NTSYS صورت گرفت و طبق نتایج، از بین 53 مؤلفۀ به‌دست‌آمده، 15 مؤلفه دارای مقادیر ویژۀ بزرگ‌تر از 1 بودند و 49/90 درصد تنوع موجود را توجیه کردند. آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد که بیشترین مقدار تنوع ژنتیکی (96درصد) در داخل جمعیت توزیع شده بود و تنوع ژنتیکی بین جدایه‌های مختلف 4 درصد تعیین گردید. نتایج این تحقیق نشان می‌دهد که بین جدایه‌های جمع‌آوری‌شده از مناطق مختلف استان تنوع ژنتیکی زیادی وجود دارد.}, keywords_fa = {بلایت آسکوکیتایی,تنوع ژنتیکی,ضریب دایس,نشانگر مولکولی .SSR}, url = {https://ijpps.ut.ac.ir/article_36673.html}, eprint = {https://ijpps.ut.ac.ir/article_36673_33efcfe0cb0559ad09be3913cb1f38b6.pdf} }