TY - JOUR ID - 72304 TI - بررسی آلودگی ارقام مختلف نیشکر به ویروس موزاییک نیشکر (SCMV) در استان خوزستان JO - دانش گیاهپزشکی ایران JA - IJPPS LA - fa SN - 2008-4781 AU - سنجابی فرد, زینب AU - رجبی معماری, حمید AU - مهرابی کوشکی, مهدی AD - دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران AD - استادیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران AD - استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران Y1 - 2019 PY - 2019 VL - 50 IS - 1 SP - 41 EP - 48 KW - آنالیز فیلوژنیکی KW - پوشش پروتئینی KW - خوزستان KW - ویروس موزاییک نیشکر DO - 10.22059/ijpps.2019.231285.1006778 N2 - ویروس موزاییک نیشکر (SCMV) یکی از بیماری‌های مهم گیاه نیشکر است. در این پژوهش غربال‌گری بیماری ویروس موزاییک نیشکر در ارقام وارداتی و نمونه‌های موجود در داخل با روش‌های مولکولی مبتنی بر اسید نوکلئیک انجام شد. در سال زراعی 94-1393، نمونه‌های دارای علائم بیماری از 90 رقم مختلف مربوط به شش کشتخوان نیشکر جمع‌آوری و بخش‌هایی از پهنک آن‌ها جداسازی شدند. نمونه‌ها در شرایط سرمای خشک- انجمادی و در ازت مایع پودر شدند. آغازگر مناسب جهت تکثیر حدود 1040 جفت باز از ناحیۀ پروتئین پوششی و پروتئین NIb طراحی و با استفاده از روش RT-PCR تکثیرشد. از بین 90 نمونۀ موردبررسی، 10 نمونۀ نیشکر با تولید قطعات تکثیری موردانتظار آلوده به ویروس موزاییک نیشکر بودند. این نمونه‌ها مربوط به ارقام IRC99-06، V58-4 و Q58 از موسسۀ تحقیقات و آموزش توسعۀ جانبی نیشکر خوزستان، IRC99-09، IRC00-21 و 4380-3 از کشت و صنعت سلمان فارسی، CP80-1557 و V68-74 از کشت و صنعت امام خمینی و دو رقم نامشخص بودند. چهار نمونه از قطعات تکثیری به‌صورت دو جهته و مستقیم توالی‌یابی و در بانک ژن ذخیره شدند. جستجوی بلاست توالی‌های مربوط به چهار جدایۀ ردیابی‏شدۀ Kh40، Kh41، Kh44 و Kh28 نشان داد که این جدایه‌ها دارای بیشترین شباهت به جدایه‏های ایرانی و آرژانتینی هستند. درخت فیلوژنتیکی ترسیمی با استفاده از الگوریتم درست‌نمائی بیشینهنشان داد که جدایه‌های ایران احتمالاً از جمعیت‌های آرژانتین و چین منشأ گرفته‌اند. UR - https://ijpps.ut.ac.ir/article_72304.html L1 - https://ijpps.ut.ac.ir/article_72304_e64b0438c83f7ef58f244d653dd90cfc.pdf ER -