c3518cb17d976b8

نویسنده

استادیار دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز

چکیده

بیماری سیگاتوکای موز یک بیماری مرکب می‎باشد که سه گونهM. musicola,
M. fijiensis و M. eumusae بعنوان عوامل اولیه ایجادکننده این بیماری به شمار می‎روند. شناسایی کلاسیک این سه گونه به خاطر همپوشانی علایم بیماری، عدم وجود تفاوت مورفولوژیک بارز در مرحله تلئومورف و عدم اسپورزایی آنها روی محیط‎های کشت مصنوعی مشکل می‎باشد. پراکنش دقیق گونه‌های فوق و اپیدمیولوژی این بیماری هنوز به طور کامل مشخص نگردیده است. علاوه بر این، دو گونه M. fijiensis و M. eumusae در بسیاری از کشورهای تولیدکننده موز حضور نداشته و گونه‎های قرنطینه‌ای به حساب می‎آیند. بنابراین، شناسایی سریع و دقیق آنها جهت به کار‌گیری استراتژی مناسب مدیریتی ضروری به نظر می‎رسد. در تحقیق حاضر آغازگر‌های اختصاصی برای هریک از گونه‎های فوق بر اساس توالی بخشی از ژن کدکننده اکتین طراحی گردیدند که به ترتیب قطعاتی به طول‎های 500 جفت باز (. fijiensis M)، 200 جفت باز (musicola M.) و 630 جفت باز (M. eumusae) را تکثیر کردند. کارآیی آغازگرهای اختصاصی هرگونه روی DNA استخراج شده از کشت‎های خالص و بافت‎های برگ‎های آلوده گیاه میزیان، آزمایش و تأیید شدند. نتایج حاصل از بررسی میزان حساسیت آغازگر‌ها نشان داد که آغازگرهای اختصاصی طراحی شده برای هر یک از گونه‎های M. Musicola، M. fijiensis و M. eumusae به ترتیب توانایی تکثیر قطعه مورد نظر با غلظت‎های 100، 10 و یک پیکوگرم DNA از گونه هدف را دارا هستند.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Molecular Detection of Mycosphaerella spp. Involved in Sigatoka Disease of Banana using Species-Specific Primer Sets

نویسنده [English]

  • Mahdi Arzanlou

چکیده [English]

The Sigatoka disease complex of banana involves three related ascomycetous fungi viz., Mycosphaerella fijiensis, M. musicola, and M. eumusae. Due to rather similar symptoms on banana, similar teleomorph morphology and problems associated with growth and sporulation in culture, species identification based on classical methods is troublesome. The exact distribution of these three species and their disease epidemiology remain unclear. Furthermore, M. fijiensis and M. eumusae have not been reported from many banana producing countries, so as to be considered as quarantine organisms. Rapid and accurate detection of these three species is essential to adopt and apply proper disease management strategy. In the present study, species-specific primer sets were developed as based on sequence data of actin gene. Species-specific primer combinations were designed with expected amplicon sizes of 500 bp from M. fijiensis, 200 bp from M. musicola, and 630 bp for M. eumusae. Accuracy and efficacy of each of species-primer sets were tested and verified on DNA extracted from pure cultures as well as DNA from naturally infected banana leaves. The sensitivity of the primer sets enabled reliable detection of M. fijiensis DNA as low as 100 pg, whereas for M. musicola and M. eumusae a higher sensitivity was achieved of 1 pg and 10 pg genomic DNA, respectively.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Actin gene.
  • M. eumusae
  • M. fijiensis
  • M. musicola
  • Molecular identification