رقیه مرادی؛ داود کولیوند؛ امید عینی گندمانی؛ محمد حاجی زاده
چکیده
بهمنظور بررسی وضعیت ویروسهای مهم متعلق به جنس نپوویروس از تاکستانهای استان زنجان، نمونهبرداری در سالهای زراعی 95-۹4 بهصورت انتخابی از گیاهان دارای نشانههای مشکوک به بیماریهای ویروسی انجام و درمجموع 168 نمونۀ گیاهی دارای نشانه و بدون نشانه گردآوری شد. استخراج آر.ان.ای کل از بافتهای برگی و آوندی 57 نمونه بر اساس ...
بیشتر
بهمنظور بررسی وضعیت ویروسهای مهم متعلق به جنس نپوویروس از تاکستانهای استان زنجان، نمونهبرداری در سالهای زراعی 95-۹4 بهصورت انتخابی از گیاهان دارای نشانههای مشکوک به بیماریهای ویروسی انجام و درمجموع 168 نمونۀ گیاهی دارای نشانه و بدون نشانه گردآوری شد. استخراج آر.ان.ای کل از بافتهای برگی و آوندی 57 نمونه بر اساس نشانهها و مناطق نمونهبرداری شده انجام گرفت و cDNA آنها ساخته شد و سپس، آزمون پیسیآر توسط آغازگرهای اختصاصی برای تکثیر (افزونش) بخشی از ژنگان (ژنوم) نپوویروسهای موزاییک آرابیس (Arabis mosaic virus, ArMV)، بدشکلی انگور (Grapevine deformation virus, GDeV)، برگ بادبزنی انگور (Grapevine fanleaf virus, GFLV) و لکۀ حلقوی گوجهفرنگی (Tomato ring spot virus, ToRSV) انجام گرفت. نتایج واکنش زنجیرهای پلمیراز گویای تکثیر قطعههای مورد انتظار از ویروسهای ArMV، GDeV، GFLV و ToRSV به ترتیب از 7/15، 7/15، 5/10 و 14 درصد نمونهها بود. پس از تعیین توالی، همردیفسازی ترادف نوکئوتیدی قطعههای تکثیرشده با دیگر توالیهای موجود در بانک ژن و تحلیل تبارزائی توسط برنامۀ MEGA6، با روش Neighbor-Joining انجام شد. بررسی رابطههای تبارزائی بر اساس توالیهای نوکلئوتیدی نشان داد، جدایههای ردیابیشده در این تحقیق با جدایههایی از کشورهای مختلف همگروهاند که در بیشتر موارد ارتباط جغرافیایی بین جدایههای ردیابی شده و دیگر جدایهها را نشان میدهد. این نخستین تحقیق جامع بر اساس دادههای مولکولی از نپوویروسهای مهم انگور در استان زنجان و نخستین گزارش ویروس بدشکلی انگور از این منطقه است.