c3518cb17d976b8

نویسندگان

چکیده

درختان نارنگی کینو دوساله پیوندشده بروی پایه رافلمون با جدایه‌های مختلفی ازقارچ میکوریزآربسکولار شامل Glomus manihotis, Gigaspora gigantean, Glomus mosseae بصورت جداگانه و مخلوط مایه‌کوبی گردیدند. پنج پرایمر اختصاصی جنس‌های Glomus و Gigaspora به نام‌های VANS1, NS21, NS61 VAGLO و VAGIGA پس از ساخت و با استفاده از DNA استخراج شده از ریشه‌های آلوده به میکوریزآربسکولار با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز مورد آزمون قرار گرفتند. دراین مطالعه پرایمر VAGLO بعنوان پرایمر اختصاصی جنس Glomus به همراه پرایمر VANS1 بعنوان پرایمر اختصاصی راسته گلومرال بصورت موفقیت‌آمیزی قطعه‌ای با اندازه 190 جفت باز از نمونه‌های G. mosseae و G. manihotis راتکثیرنمود. کاربرد این پرایمرها بر روی نمونه‌های حاوی G. gigantean و همچین شاهد (گیاهان مایه‌کوبی نشده) منجربه تولید این قطعه نگردید. استفاده ازجفت پرایمر VANS1-NS61 برای تکثیر قطعه نسبتاً کاملی از ژن‌های هسته‌ای با اندازه حدود 1 کیلوباز که زیر واحد کوچکی از rRNA را کد می‌نمایند موفقیت‌آمیز بود و استفاده از این قطعه بعنوان DNA الگو پس ازیک چرخه اضافی PCR (به منظورتکثیربیشتر) به همراه جفت پرایمرهای VANS1-VAGLO و VANS1-VAGIGA منجر به تولید قطعه‌ای از DNA در اندازه مورد انتظاربرای جفت پرایمراول گردید و در مورد جفت پرایمر دوم نتیجه‌ای در پی نداشت. این تحقیق به وضوح نشان‌دهنده امکان استفاده از این تکنیک بعنوان ابزاری دقیق و سریع برای نشان دادن و شناسایی قارچ میکوریزآربسکولاردرون ریشه های نارنگی کینو می‌باشد.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

An Identification of Arbuscular Mycorrhizal Fungus in Kinnow Mandarin (Citrus nobilis x Citrus deliciosa) Grafted on Rough Lemon Rootstock by Polymerase Chain Reaction Technique

نویسندگان [English]

  • mohammad hossein shamshiri
  • Boupindar sing

چکیده [English]

An experiment was conducted, using two year old Kinnow plants, budded on rough lemon rootstock, inoculated with different isolates of AMF fungi viz., Glomus manihotis, Gigaspora gigantean and Glomus mosseae singly as well as in mixed culture. Five primers VANS1, NS61,NS21,VAGLO,VAGIGA specific to Glomus and Gigaspora species were designed and used in a polymerase chain reaction with DNA extracted from mycorrhizal roots varying in colonization. Glomus family-specific VAGLO primer in conjunction with Glomerales-specific VANS1 primer, successfully amplified 190bp fragment from samples of G. manihotis and G. mosseae. This 190bp product was not detected with G. gigantean and in the un-inoculated, non colonized control plants. Use of primer pair VANS1-NS61 for amplification of around 1kb fragment belonging to nearly complete gene coding for the small subunit rRNA was successful. Further use of this 1kb product as template DNA after one more round of PCR (for more amplification) in conjunction with primer pair VANS1-VAGLO and VANS1-VAGIGA produced an amplicon with an expected size only for the first primer pair and not for the second primer pair. This study clearly indicates the possibility of using this technique as a tool for rapid and precise detection and identification of arbuscular mycorrhizal fungi in Kinnow roots.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Gigaspora
  • Glomus
  • Kinnow
  • Mycorrhiza
  • polymerase chain reaction