نویسندگان
چکیده
چهل جدایه تک اسپور Magnaporthe grisea، به منظور شناسایی گروه‌های سازگاری رویشی و تعیین تنوع ژنتیکی بر اساس انگشت نگاری DNA به روش rep-PCR در این تحقیق استفاده شدند. جدایه‌ها در سال‌های 1382-1384 از تعدادی علف هرز تیره گرامینه شامل علف انگشتی (Digitaria sanguinalis)، ارزن دم روباهی (Setaria italica)، سوروف (Echinochloa crus-galli) و علف هرز نامعلوم جمع‌آوری گردیدند و در کلکسیون قارچ‌شناسی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران نگهداری شدند. برای شناسایی گروه‌های سازگاری رویشی، جهش یافتگان nit در محیط حداقل حاوی 6%- 5% کلرات جداسازی و آزمون‌های مکمل سازی جهش یافته‌های nit در تمام حالات ممکن روی محیط حداقل انجام شد. سه گروه سازگاری رویشی VCG1، VCG2 و VCG3 در بین جدایه‌ها تشخیص داده شدند. گروه VCG1 با 29 جدایه، گروه غالب بود. برای تعیین تنوع ژنتیکی و شناسایی دودمان‌های کلونی پراکنده در جمعیت قارچ، از دو آغازگر بر اساس توالی نوکلئوتیدهای قطعه ERIC و BOX طراحی شده، استفاده گردید. قطعات DNA با طولی بین 420 تا 3000 جفت باز تکثیر شدند. شش دودمان کلونی در بین جدایه‌ها شناسایی و با حروف A، B، C، D، E و F مشخص شدند. دودمان کلونی A با فراوانی حدود 5/62 % دودمان کلونی غالب را تشکیل داد. این تحقیق نشان داد بر خلاف نتایج گروه‌های سازگاری رویشی که جدایه‌های حاصل از ارزن دم روباهی و علف انگشتی با هم تشکیل هتروکاریون دادند، در تعیین تنوع ژنتیکی به روش مولکولی از یکدیگر با 40 % شباهت تفکیک شدند. هر دو روش نشان داد که تنوع ژنتیکی کمی در درون جمعیت قارچ در روی علف‌های هرز وجود دارد.
کلیدواژه‌ها
عنوان مقاله [English]
A Study on Population Structure of Magnaporthe grisea (Hebert) Barr Isolated from some Poaceae Weeds, Based on Identification of VCGs and rep-PCR DNA Fingerprinting
نویسندگان [English]
- parastoo motalebi
- mohammad javan nikkhah
- seyed mohmood okhovat
- khalil bardi fotoohi far
- keyvan ghazanfari
چکیده [English]
Forty monoconidial isolates of Magnaporthe grisea were examined, for an identification of vegetative compatibility group and a characterization of genetic diversity, using rep-PCR genomic fingerprinting. The isolates were collected from weeds Digitaria sanguinalis (crabgrass), Setaria italica (foxtail millet), Echinochloa crus-galli (barnyard millet), and some other unknown ones during 2003 - 2005 and preserved in the Mycology collection of the College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj. Nit mutants were obtained from fast growing sectors on Minimal Medium (MM) containing 5-6% potassium chlorate. Complementation between nit mutants of isolates was tested on MM. Three vegetative compatibility groups were determined including VCG1, VCG2 and VCG3, the VCG1 with 29 isolates forming the dominant VC group among others. Genetic diversity of
M.grisea isolates was studied based on DNA fingerprinting through rep-PCR, using two primers previously designed based on ERIC and BOX regions. They generated variable length fragments ranging from 420 to 3000 bp. Phenetic analysis differentiated six distinct clonal lineages designated as A to F. Clonal lineage A with a 62.5% frequency, was the largest fingerprinting group. This study revealed that isolates obtained from foxtail millet and crabgrass were designated in the same VC groups, forming heterokaryons with each other, however these isolates separated from each other the by 42% of similarity using rep-PCR marker. The correlation between VCGs and clonal lineages demonstrated low genetic diversity in M. grisea population within weeds.
کلیدواژه‌ها [English]
- Clonal lineage.
- Nit mutant
- Poaceae
- Pyricularia grisea
- Repetitive DNA
)