c3518cb17d976b8

نویسندگان

چکیده

نمونه‌برداری از مزارع برنج در مناطق مختلف استان مازندران انجام شد. نمونه‌های خاک و اندامهای هوایی برنج به آزمایشگاه منتقل گردید و جدایه‌های Trichodermaبا استفاده از محیط کشت انتخابی RBSF از آنها جداسازی شدند. 202 جدایه به روش تک اسپور خالص‌سازی و DNA ژنومی آنها با استفاده از کیت استخراج شد. برای شناسایی جدایه‌های مذکور،
صفات مورفولوژیکی و نیز صفات ملکولی آنها مورد بررسی قرار گرفتند. صفات مورفولوژیکی جدایه‌های Trichoderma با استفاده از کلیدهای شناسایی معتبر مطابقت داده شدند و
به منظور شناسایی بر پایه مشخصه‌های ملکولی، منطقه ITSاز rDNA شامل ITS1، ژن 5.8Sو ITS2 با استفاده از آغازگرهای ITS1 و ITS4 تکثیر شد. با داشتن توالی ITS، جدایه‌ها
با استفاده از برنامه TrichOKEY 2 شناسایی شدند. جدایه‌های شناسایی شده به شش گونة Trichoderma harzianum، T. virens،T. atroviride ، T. hamatum، T. brevicompactum و T. asperellum تعلق دارند. بیش از 90 درصد جدایه‌های Trichoderma به گونه‌های T. harzianum و T. virens تعلق دارند. بنابراین این دو گونه که از نظر کنترل بیولوژیک بیماری‌های گیاهی حائز اهمیت هستند، فراوان‌ترین گونه‌های Trichoderma در مزارع برنج می‌باشند. T. harzianum گونه غالب خاک و اندام‌های هوایی گیاه برنج بوده و گونه T. virens بیشتر در خاک شالیزار به سر می‌برد. هیچکدام از جدایه-های مربوط به بقیه گونه‌ها از اندام‌های هوایی جدا نشدند. همچنین جدایه‌های T. atroviride، به جز یک جدایه، همگی از مزارع شرق مازندران جدا شدند.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Frequency and Distribution of Trichoderma spp. in the Rice (Paddy) Fields of Mazandaran Province, Iran

نویسندگان [English]

  • Shahram Naeimi
  • Mahmoud Okhovat
  • Mohammad JavanNikkhah
  • Laslou Kredics
  • Vahid Khosravi

چکیده [English]

Samples were collected from soil and as well from phyllosphere of rice plant and subjected to dilution plate technique on RBSF Trichoderma selective medium. A total of 202 Trichoderma isolates were obtained from rice fields at different geographical locations distributed all over Mazandaran Province. Single spore isolates were obtained and genomic DNA extracted from all the isolates using DNA extraction kit. For an identification of isolates, morphological as well as molecular characteristics were studied. Morphological identifications were accomplished through morphological keys and subsequent descriptions. For molecular identification, the Internal Transcribed Spacer (ITS) region of the rDNA gene complex, including ITS1, the 5. 8S rRNA gene and ITS2 was amplified using primers ITS1 and ITS4. To identify the isolates at the species level, ITS sequence analysis was carried out for all isolates with the aid of the program TrichOKEY 2. The identified isolates belonged to six species of: Trichoderma harzianum, T. virens, T. atroviride, T. hamatum, T. brevicompactum and
T. asperellum. More than 90 percent of the isolates belonged to species T. harzianum and
T. virens. Therefore, these two important biocontrol agent species of plant diseases, are the most common ones occurring in the rice (paddy) fields. T. harzianum is the most dominant Trichoderma species observed in rice phyllosphere while T. virens being more abundant in soil. None of the isolates of the four remaining species were isolated from phyllosphere. In addition, all T. atroviride isolates, except for one, originate from the eastern part of the Mazandaran province.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Distribution ITS sequences
  • frequency
  • Rice (paddy) fields
  • Trichoderma harzianum
  • T. virens