c3518cb17d976b8

بررسی تنوع ژنتیکی برخی از جدایه‌های قارچ Macrophomina phaseolina با استفاده از نشانگر‌های مولکولی PCR-RFLP و RAPD

نویسندگان

چکیده

پوسیدگی ذغالی با عامل Macrophomina phaseolina یکی از بیمار‎یهای مهم اقتصادی می‎باشد که سبب کاهش عملکرد در گیاهان زراعی و باغی می‎شود. تعداد 33 جدایه از قارچ M. phaseolina بدست آمده از میزبان‌های متفاوت مانند سویا، خربزه، لوبیا، نخود، کاج، کوکب‎کوهی، کیوی، پنبه و کنجد جمع‌آوری شدند. شدت بیماریزایی جدایه‎ها روی بذور خربزه در شرایط آزمایشگاه ارزیابی شد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌ها از نشانگرهای مولکولی RAPD و PCR-RFLP استفاده شد. تکثیر نواحی ITS با استفاده از آغازگر‌های ITS5 و LR5 تنها یک قطعه DNA 1600 جفت بازی را تولید کرد. نتایج نشان داد که با کاربرد نشانگر‎های RAPD تنوع ژنتیکی بین جدایه‎ها وجود دارد. داده‌های RAPD بر اساس پنج آغازگر تصادفی در 16 جدایه، درجه بالایی از چندشکلی را در جدایه‌های مختلف نشان دادند. دندروگرام به روش UPGMA که با داده‎های RAPD رسم شد، نه گروه در سطح شباهت 70 درصد ایجاد کرد. جدایه‌های که از مناطق مشابه بودند تمایل به گروه‎های نزدیک را داشته که نشان دادند که از نظر ژنتیکی به هم مرتبط‌اند.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

A Study on Genetic Diversity of Some Isolates of Macrophomina phaseolina Using Molecular Marker; PCR-RFLP and RAPD

نویسندگان [English]

  • Akram Bakhshi
  • Hasan Reza Etebarian
  • Heshmatolah Aminian
  • Mohsen Ebrahimi
چکیده [English]

Charcoal rot caused by Macrophomina phaseolina is an injurious and economically important disease which causes heavy loss of yield to field and horticultural crops. Thirty-three isolates of M. phaseolina were obtained from different host plants such as: soybean (Glycine max.), melo (Cucumis melo), bean (Phaseolus vulgaris), pea (Pisum sativum), pinus (Pinus sp), blak-eyed susan (Rudbeckia fulgida), kiwifruit (Actiniadia deliciosa), cotton (Gossypium arboreum), and sesame (Sesamum indicum). Pathogenicity test was performed on seeds of melo in in vitro conditions. To study the genetic diversity of isolates PCR-RFLP and RAPD markers were employed. Amplification of the ITS region using ITS5 and LR5 primers produced only one DNA fragment of 1600 bp. Results indicated genetic variability among isolates of M. phaseolina through application of RAPD marker. RAPD data based on five random primers tested on sixteen isolates revealed a high degree of polymorphism in different isolates. UPGMA dendrogram based on RAPD data, produced 9 clusters at the level of 70% similarity. Isolates from the same locations showed a tendency to belong to closer groups, indicating closer genetic relatedness.

کلیدواژه‌ها [English]

  • .
  • Biodiversity
  • Charcoal rot
  • Genome
  • ITS region