c3518cb17d976b8

مطالعه وضعیت باروری جنسی وتعیین فراوانی آلل‌های تیپ آمیزشی در جمعیت‌های آمیزشی A و D از گونه مرکب Gibberella fujikuroi بدست آمده از برنج و ذرت به کمک PCR

نویسندگان

چکیده

به منظور بررسی وضعیت باروری جنسی و تیپ آمیزشی گونه‌های Gibberella moniliformis و G. intermedia، عوامل پوسیدگی طوقه یا باکانه برنج و پوسیدگی خوشه و ساقه ذرت از گونه مرکب G. fujikuroi به کمک واکنش زنجیره‌ای پلیمراز، از 128 جدایه تک اسپور بدست آمده از مزارع برنج استان‌های گیلان و مازندران و مزارع ذرت استان‌های مختلف ایران شامل 16 جدایه G. moniliformis از برنج و 54 جدایه از ذرت، 28 جدایه G. intermedia از برنج و 30 جدایه از ذرت استفاده شد. از بین این جدایه‌ها 30 جدایه G. intermedia از ذرت، 12 جدایه از برنج و پنج جدایه G. moniliformis از برنج در مطالعه وضعیت باروری جنسی به کمک جدایه‌های آزمایشگر استاندارد روی محیط غذایی هویج آگار استفاده گردید. جهت تعیین تیپ آمیزشی و وضعیت باروری جدایه‌ها از روش multiplex PCR و دو جفت آغازگر اختصاصی به نام‌های GFmat1a،GFmat1b و Gfmat2c، Gfmat2d استفاده شد و وجود و فراوانی هریک از ایدیومورف‌های تیپ آمیزشی در تمام جدایه‌ها ردیابی و تعیین گردید. از مجموع 68 جدایه G. moniliformis از برنج و ذرت، 47 جدایه (69 درصد) متعلق به MAT-1 و 21 جدایه (31 درصد) متعلق به MAT-2 بودند. از مجموع 53 جدایه G. intermedia از برنج و ذرت، 33 جدایه (62 درصد) متعلق به تیپ آمیزشی MAT-1 و 20 جدایه (38 درصد) متعلق به تیپ آمیزشی MAT-2 بودند. از 42 جدایه G. intermedia حاصل از برنج و ذرت که در تلاقی با جدایه های استاندارد استفاده گردیدند، 26 جدایه (62 درصد) دارای تیپ آمیزشی MAT-1 و 16 جدایه (38 درصد) دارای تیپ آمیزشی MAT-2 بودند. نتایج حاصل از تلاقی جدایه‌های مورد مطالعه با جدایه‌های استاندارد با نتایج حاصل از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز مشابه بود. همچنین جدایه‌های مزرعه‌ای دارای تیپ آمیزشی مخالف (سازگار) با یکدیگر تلاقی داده شدند و پریتسیومی مشاهده نشد که نشان‌دهنده نربارور بودن جدایه‌ها می‌باشد. برای بروز نوترکیبی جنسی و تنوع ژنتیکی درون یک جمعیت وجود هر دو آلل از تیپ‌های آمیزشی مختلف با فراوانی مناسب و اینکه حداقل یکی از دو والد ماده بارور یا هرمافرودیت باشد، ضروری می باشد. در این تحقیق، هر دو تیپ آمیزشی در جمعیت هر دو گونه قارچ شناسایی شدند که البته فراوانی تیپ آمیزشی MAT-1 نسبتا بیشتر بود ولی با توجه به کم بودن افراد ماده بارور در جمعیت، بروز تنوع ژنتیکی در جمعیت قارچ‌های G. moniliformis و G. intermedia بدست آمده از برنج و ذرت می‌تواند از طریق مکانیسم‌های دیگر تغییرپذیری باشد.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Study on Fertility Status and Determination of Frequency of Mating Type Alleles in A and D Mating Populations of Gibberella fujikuroi from Rice and Corn Based on PCR

نویسندگان [English]

  • Elham Mohamadian
  • Mohamad JavanNikkhah
  • Seyed Mahmoud Okhovat
  • Keyvan Ghazanfari
چکیده [English]

Fertility status and distribution of mating type alleles of Gibberella moniliformis and G. intermedia, both the causal agents of the foot rot and bakanae of rice, as well as stalk and root rot of corn were studied using specific primers. One hundred and twenty eight single-spore isolates were collected from rice growing areas of Guilan and Mazandaran and from various corn-growing areas of Iran. Sixteen isolates of G. moniliformis from rice and 54 isolates from corn, 28 isolates of G. intermedia from rice and 30 isolates from corn were taken into account for the study. Also 30 isolates of G. intermedia from corn and 12 isolates from rice, 5 isolates of G. moniliformis from rice were paired with standard tester isolates. A multiplex PCR technique was employed to distinguish idiomorphs MAT-1 and MAT-2 by using two pairs of specific primers GFmat1a, GFmat1b, and Gfmat2c, Gfmat2d. Among 68 isolates of G. moniliformis, 47 (69%) were identified as MAT-1 and 21 isolates (31%) belonged to MAT-2. Among 53 isolates 0f G. intermedia, 33 (62%) were identified as MAT-1 and 20 isolates (38%) belonged to MAT-2. Among 42 isolates of G. intermedia which were crossed with tester isolates, 26 (62%) were MAT-1 and 16 (38%) were MAT-2. The results of PCR were similar to those predicted as based on the results of crosses. Field isolates belonging to MAT-1 and MAT-2 were crossed with each other but no perithecium was formed. This indicated that all the isolates are female-sterile or male-fertile. The existence of both opposite mating type alleles with favorable frequency and different parents is an important occurrence of genetic diversity in the population of fungi. With regard to that, two mating type alleles found in the studied populations were of relatively high frequency of MAT-1 but because of the low level of female-fertile, occurrence of genetic diversity in the populations of G. moniliformis and G. intermedia coming from rice and corn could be attributed to other mechanisms of variability.

کلیدواژه‌ها [English]

  • .
  • ..
  • Ear and stalk rot of corn
  • Foot rot of rice
  • Mating type alleles