c3518cb17d976b8

مقایسه DNA بارکدینگ با روش کلاسیک در جهت تشخیص پنج گونه شته درختان میوه در مشهد

نویسندگان

1 دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد

2 استادیار دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد

3 استاد دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد

چکیده

شته‌ها از آفات مهم کشاورزی هستند، اما گرایش تکاملی آنها به سمت کاهش ویژگی‌های مفید تاکسونومیک و تغییر‌پذیری صفات ظاهری به‌دلیل تأثیر عوامل محیطی و میزبان گیاهی، شناسایی مرفولوژیک آنها را در برخی مواقع دچار مشکل می‌نماید. مدیریت صحیح این آفات مستلزم شناسایی دقیق آنها است، لذا استفاده از روش‌های نوین شناسایی می‌تواند در زمینه کنترل این آفات راه‌گشا باشد. در مطالعه‌ای که به‌منظور شناسایی شته‌های درختان میوه دانه‌دار، طی سال‌های 1387تا 1389 در شهرستان مشهد انجام گرفت، علاوه بر روش‌های مورفولوژیک رایج از روش شناسه‌گذاری (بارکدینگ) DNA نیز استفاده گردید. در این بررسی گونه‌های Allocotaphis quaestionis، Aphis pomi، Dysaphis affinis، D. plantaginea و Nearctaphis bakeri از روی سیب، به و گلابی جمع‌آوری گردید که گونه A. quaestionis برای اولین بار از ایران گزارش می‌شود. بارکد DNA برای ناحیه cox1 این گونه‌ها تهیه و روابط تبارشناسی میان گونه‌های جمع‌آوری شده و سایر گونه‌های این خانواده بررسی گردید. براساس این شناسه، شناسایی ظاهری تأیید شد و نتایج داده های مولکولی با مشخصات مرفولوژیک و گروه بندی کلاسیک انطباق داشت و گونه‌های مورد مطالعه بر اساس جنس و قبیله تفکیک شدند. استفاده از خط شناسه‌گذاری (DNA بارکد) به عنوان ابزاری برای شناسایی شته‌ها برای اولین بار در ایران انجام گرفت و نتایج این مطالعه مؤید این است که توالی cox1 می‌تواند در مطالعه تعیین هویت و بررسی روابط تبارشناسی شته‌ها به کار رود.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

A Comparison of DNA Barcoding with Classic Method in Diagnosis Five of Aphid Species on Pome Fruit Trees in Mashhad

نویسندگان [English]

  • Reyhaneh Darsouei 1
  • Javad Karimi 2
  • Mehdi Modarres Avval 3
چکیده [English]

Aphids are among important agricultural pests. The pest's evolutionary tendency towards a loss of taxonomically useful characteristics, as well as morphological plasticity due to host type and as a result of environmental factors, make a morphological identification of aphids difficult, whereas exact identification is indispensable for managment of these pests. Thus, modern identification methods could help in managing these pests. In this study conducted during 2008-2010 on trees in pome fruit orchards in Mashhad region of Iran, classic method accompanied with DNA barcoding was employed for an identification of aphid pests. Aphis pomi, Dysaphis afiinis, D. plantaginea, Nearctaphis bakeri and Allocotaphis quaestionis were collected from apple, quince and pear trees, A. quaestionis being reported for the first time from Iran. DNA barcoding was provided for cox1 gene in these species and phylogenetic relationship investigated among the collected species as well as other species within the family. DNA barcoding confirmed the morphological identification. Results of molecular data were compatible with morphological characteristics and classic grouping, separating the studied species as based on genus and tribe. This is the first data gathered about aphid characterization in Iran while applying DNA barcoding. The results of this study indicate that cox1 sequence could be useful in aphids' identification and recognition of their internal relationships.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Aphid
  • COX1
  • DNA barcoding
  • Neighbor joining