c3518cb17d976b8

دامنه میزبانی و برخی مشخصات مولکولی تعدادی از جدایه های ویروس موزائیک یونجه در استان کرمان

نویسندگان

1 دانشجوی ارشد دانشگاه باهنر کرمان

2 دانشیار دانشگاه باهنرکرمان

3 دانشیار باهنرکرمان

چکیده

ویروس موزائیک یونجه (Alfalfa mosaic virus, AlMV) یکی از مهم ترین ویروس های یونجه در سرتاسر دنیاست. به منظور مطالعه جدایه های این ویروس در استان کرمان، در طی سالهای 1386 تا 1387 از 514 بوته یونجه با علائم موزائیک، زردی، تاولی شدن سطوح برگ ها، بدشکلی و پیچیدگی و 66 بوته سیب زمینی با علائم زرد ابلقی (Calico)، در شهرستان های مختلف استان کرمان نمونه برداری به عمل آمد. آلودگی نمونه های فوق به AlMV با استفاده از آزمون سرولوژیکی الایزای غیر مستقیم (Indirect ELISA) و واکنش RT-PCR با استفاده از جفت آغازگر اختصاصی چارچوب ژنی پروتئین پوششی (CP) اثبات گردید. در مطالعات بیولوژیکی، نمونه های آلوده در شرایط گلخانه بر روی گیاهان محک مایه زنی گردیدند. جدایه های مختلف، در ارقام مختلف توتون (Nicotiana tabacum L.) علائم بسیار متنوعی ایجاد کردند و در بوته های داتوره (Datura maxima) فقط دو جدایه Ke. Si. Al و Ke. Ba. Al علائم ویروسی متفاوتی به ترتیب به صورت ایجاد علائم توته ای و لکه های موضعی نکروز ایجاد نمودند. از بین جدایه های جمع آوری شده، چهار جدایه (شامل سه جدایه یونجه و یک جدایه سیب زمینی) براساس موقعیت جغرافیایی به منظور مطالعات مولکولی انتخاب گردیدند. واکنش RT-PCR با استفاده از جفت آغازگر اختصاصی پروتئین پوششی ویروس منجر به تکثیر قطعه ای به طول 780 جفت باز شد. پس از همسانه سازی جدایه های ایرانی، تعیین ترادف و مقایسه آنها با ناحیه متناظر از جدایه های موجود در بانک ژن، بیانگر درصد تشابه بالا در ترادف اسید نوکلئیک (3/98-9/92%) و اسید آمینه ترجمه شده از ترادف نوکلئوتیدی (100- 9/91%) بین جدایه های ایرانی با جدایه های ایتالیایی این ویروس بود. در درخت فیلوژنتیکی رسم شده براساس ترادف نوکلئوتیدی ناحیه CP، جدایه های AlMV مورد بررسی در این تحقیق و جدایه های ایتالیایی در یک شاخه و جدایه های فرانسوی در شاخه ای جداگانه قرار گرفتند. بررسی بیولوژیکی و تعیین جایگاه فیلوژنتیکی جدایه های AlMV مربوط به استان کرمان برای اولین بار گزارش می شوند.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Host Range and Partial Molecular Characterization of Alfalfa Mosaic Virus Isolates in Kerman Province

نویسندگان [English]

  • fateme mangoli 1
  • hossein massomi 2
  • jahangir heydarnejad 3
  • akbar hosseini poor 3
1
2
3
چکیده [English]

Alfalfa mosaic virus (AlMV) is one of the most conspicuous alfalfa viruses in the world. In order to identify the distribution, host range and molecular characterization of Alfalfa mosaic virus in Kerman province, 514 alfalfa samples showing mosaic, Calico, mottle and malformation symptoms as well as 66 potato samples showing calico symptoms were collected from alfalfa and potato fields in Kerman, Jiroft, Kahnooj, Shahrbabak, Baft, Sirjan and Bardsir regions, Kerman Province. Infection of samples was analyzed through, enzyme-linked immunosorbent assay. In host range studies, AlMV isolates induced different symptoms on several varieties of Nicotiana tabacum L. From among all the Iranian AlMV isolates, only two, namely: Ke. Si. Al, and Ke. Ba. Al caused different viral symptoms including enation and necrotic local lesions on Datura maxima, respectively. As Based on geographical location and biological properties, four isolates were selected for molecular investigation. The whole Coat Protein (CP) gene from four AlMV isolates (three alfalfa and one potato isolate) were PCR-amplified, cloned, sequenced and compared with the counterpart sequences available in the GeneBank. The CP gene of four Iranian isolates of AlMV showed nucleotide and amino acid sequence identities in the ranges between 92.9-98.3 and 91.9-100%, respectively. In phylogenetic analysis, all the four Iranian AlMV isolates were clustered in the Italian group. This is the first report on biology and CP sequence analysis of AlMV isolates from Kerman province in Iran.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Alfalfa mosaic virus
  • Indirect ELISA
  • RT-PCR

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار