c3518cb17d976b8

بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌های Ascochyta rabiei، عامل برق‌زدگی نخود در استان لرستان با استفاده از نشانگر SSR

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، دانشگاه زابل

2 استادیار دانشگاه زابل

3 استاد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

4 استادیار، دانشگاه علوم کشاورزی گرگان

5 دانشیار دانشگاه زابل

چکیده

بیماری برق‌زدگی با عامل Ascochyta rabiei یکی از مخرب‌ترین بیماری‌های نخود است. در این تحقیق، با هدف مطالعۀ ساختار ژنتیکی قارچ عامل بیماری، نمونه‌برداری به‌صورت تصادفی از مزارع هشت منطقۀ مختلف استان لرستان (ازنا، الشتر، بروجرد، پلدختر، چگنی، خرم‌آباد، کوهدشت و نورآباد) صورت گرفت. پس از کشت نمونه‌ها روی محیط کشت اختصاصی آرد نخود، دکستروز و آگار، جدایه‌های قارچی با روش نوک هیف خالص‌سازی شد و تعداد 53 جدایۀ خالص به‌دست آمد. تنوع ژنتیکی جمعیت قارچ با نشانگر توالی تکراری ساده و با استفاده از پنج جفت آغازگر اختصاصی ارزیابی شد. تعیین تشابه جدایه با استفاده از ضریب شباهت دایس و روش الگوریتم UPGMA انجام گرفت. تجزیۀ خوشه‌ای داده‌ها نشان داد که جدایه‌ها در فاصلۀ ژنتیکی برابر با سطح تشابه 3/0 درصد در 9 گروه ژنوتیپی مشخص قرار می‌گیرند. آنالیز PCOA داده‌ها با استفاده از ماتریس تشابه جاکارد در نرم‌افزار NTSYS صورت گرفت و طبق نتایج، از بین 53 مؤلفۀ به‌دست‌آمده، 15 مؤلفه دارای مقادیر ویژۀ بزرگ‌تر از 1 بودند و 49/90 درصد تنوع موجود را توجیه کردند. آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد که بیشترین مقدار تنوع ژنتیکی (96درصد) در داخل جمعیت توزیع شده بود و تنوع ژنتیکی بین جدایه‌های مختلف 4 درصد تعیین گردید. نتایج این تحقیق نشان می‌دهد که بین جدایه‌های جمع‌آوری‌شده از مناطق مختلف استان تنوع ژنتیکی زیادی وجود دارد.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Study on the Genetic Diversity of Ascochyta rabiei Isolates, Cause of Chikpea Blight Disease in Lorestan Province Using SSR Marker

نویسندگان [English]

  • Mansoureh Rahimi 1
  • Seyed Kazem Sabbagh 2
  • Mohammad Javan Nikkhah 3
  • Hasan Soltanloo 4
  • Mohammad Salari 5
  • Naser Panjehkeh 5
1 Former MSc. Student, University of Zabol, Iran
2 Assistant Professor, University of Zabol, Iran
3 Professor, University College of Agriculture and Natural Resourses, University of Tehran, Karaj, Iran
4 Assistant Professor, University of Gorgan,Gorgan, Iran
5 Associate Professors, University of Zabol, Iran
چکیده [English]

Ascochyta blight caused by Ascochyta rabiei is one of the most destructive diseases
affecting chickpea (Cicer arietinum). To study the genetic diversity of the fungus, fifty three
isolates were rendomly collected from chikpea fields in eight different regions of Lorestan
Province namely Azna, Aleshtar, Broujerd, Poldokhtar, Chegeni, Khoorramabad, Koohdasht,
Noorabad.The isolates were cultured and purified on specific chickpea seed meal dextrose agar
medium. Genetic diversity among the population was assayed, employing SSR marker and
using five specific primer pairs. Similarity of the isolates was determined using Dice's
coefficient and UPGMA clustering method. Cluster analysis of data revealed that isolates with
genetic similarity distance equal to 3% were placed in 9 distinct genetic groups. PCoA analysis
of data was done employing Jaccard similarity matrix in NTSYS software. According to the
acquired data, from among 53 components, 15 components stood within an Eigenvalue greater
than 1 with 90.49 % of variation being justified. Analysis of molecular variance (AMOVA)
revealed the highest genetic variation (96%) within populations while distributed among
populations by 4%.The results finally indicated that there is considerable genetic diversity
among and between the isolates collected from different regions of the province.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Ascochyta blight
  • Dice's coeffecient SSR marker
  • Genetic diversity

فایل ها

سابقه مقاله

  • تاریخ دریافت: 31 خرداد 1391
  • تاریخ بازنگری: 07 خرداد 1393
  • تاریخ پذیرش: 16 بهمن 1392

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار