c3518cb17d976b8

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، دانشیار و استادیار،گروه گیاه‌پزشکی، دانشکدۀ علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج

2 استادیار، گروه علوم باغبانی، دانشکدۀ علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج

3 پژوهشکدۀ بیوتکنولوژی کشاورزی شمال غرب و غرب کشور، تبریز

چکیده

در سال­های 1388-1387، تعداد 154 پداژه از مراکز توزیع پداژه­های گلایل در کرج جمع‌آوری و پس از کشت، بررسی بافت برگ بوته­ها با آزمونDAS-ELISA حاکی از آلودگی 02/74 درصد بوته­ها به ویروس موزاییک زرد لوبیا (Bean yellow mosaic virus, BYMV) بود. پس از خالص­سازی بیولوژیکی و تکثیر جدایه­ای به نام BYMV-GPK، دامنه  میزبانی آن تعیین شد. وزن مولکولی پروتئین پوششی جدایه با استفاده از روش SDS- PAGE، 34 کیلودالتون محاسبه گردید و از طریق آزمون وسترن بلات تأیید شد. بررسی حساسیت آزمون­های سرولوژیکی ایمنی‌سنجی اثر بافت (TPIA) وDAS-ELISA  در ردیابی BYMV در بافت‌های برگ و پداژه­ها نشان داد هر دو روش ویروس را به‌آسانی در بافت برگ بوته­های گلایل آلوده ردیابی کردند اما هیچ‌یک از این دو روش قادر به ردیابی ویروس در بافت پداژه‌های آلوده نبود. دو    بخش انتهای ´3 و ناحیه HC-Pro ژنوم این جدایه، به‌ترتیب به اندازۀ 600 و 1100 جفت باز، با روش RT-PCR تکثیر گردید. در تحلیل فیلوژنتیکی براساس ترادف­ نوکلئوتیدی و ترجمۀ اسید آمینه­ای این نواحی، جدایه­های مختلف ویروس تفکیک شد و جدایة GPK  در کنار جدایه‌های گلایل یا شبدر قرار گرفت.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

BIOLOGICAL AND PHYLOGENETIC CHARACTERISTICS OF AN IRANIAN GLADIOULS ISOLATE OF Bean yellow mosaic virus

نویسندگان [English]

  • Parisa Sharifi Nezam Abad 1
  • Mina Koohi Habibi 1
  • Akbar Dizadji 1
  • Siamak Kalantari 2
  • Masoumeh Ranjbar Aghdam 3

چکیده [English]

During 2008-2009, a total of 154 gladiolus (Gladiolus grandiflorus) corms were collected from the distribution centers in Karaj (Iran). After cultivation, fresh leaf samples of all germinated corms were tested by DAS-ELISA, which revealed the infection of 74.02% of plants with Bean yellow mosaic virus (BYMV). Following biological purification of an isolate, designated as BYMV-GPK, its host range was determined. The molecular mass of BYMV-GPK coat protein was estimated as 34 KDa by SDS-PAGE, which was confirmed by western blot analysis. DAS-ELISA and tissue print immunoassay (TPIA) techniques showed similar sensitivity in detection of BYMV in leaf tissue of infected gladiolus plants, but none of them was able to detect BYMV in corm tissue of the same infected plants. Two fragments of GPK genome, corresponding to HC-Pro and 3´ end regions with 600 and 1100 bp in length, respectively, were amplified by RT-PCR. Phylogenetic analysis based on the nucleotide and deduced amino acid sequence of HC-Pro and genomic 3´ end region showed that BYMV isolates clustered into separate groups according to their host origin and GPK isolate was closely related to a trifolium and other gladiolus isolates.

کلیدواژه‌ها [English]

  • BYMV
  • gladiolus
  • phylogeny
  • TPIA
  • western blot